2012年，余功茂在家中晕倒，送到医院后诊断为由遗传性疾病多囊肾引起的脑部动脉瘤。医院给他做了8个小时的开颅手术。当天脑动脉瘤发作时脑部血压骤然增高，导致左眼失明，他又接受了眼部手术。后来，他的多囊肾疾病再度发作，引发尿毒症，必须每周到医院接受3次血液透析。
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